Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApoeP08226 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApoeP08226 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ApoeP08226 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms