Protein–RNA interactions for Protein: P07744

Krt4, Keratin, type II cytoskeletal 4, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt4P07744 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt4P07744 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt4P07744 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt4P07744 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt4P07744 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt4P07744 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt4P07744 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt4P07744 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt4P07744 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt4P07744 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt4P07744 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt4P07744 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt4P07744 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt4P07744 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt4P07744 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt4P07744 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt4P07744 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt4P07744 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt4P07744 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt4P07744 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt4P07744 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt4P07744 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms