Protein–RNA interactions for Protein: P05214

Tuba3a, Tubulin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba3aP05214 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tuba3aP05214 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms