Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01672 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01672 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01672 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01672 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01672 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01672 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01672 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01672 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01672 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01672 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01672 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01672 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01672 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01672 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01672 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01672 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01672 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01672 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01672 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01672 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01672 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01672 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01672 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01672 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01672 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01672 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01672 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01672 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01672 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01672 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01672 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01672 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01672 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01672 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01672 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01672 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01672 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01672 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01672 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01672 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01672 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01672 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01672 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01672 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01672 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01672 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01672 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01672 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01672 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01672 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01672 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01672 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01672 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01672 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01672 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01672 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01672 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01672 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01672 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01672 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01672 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01672 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01672 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01672 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01672 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01672 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01672 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01672 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01672 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01672 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms