Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Ccl20O89093 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
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Ccl20O89093 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccl20O89093 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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