Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms