Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns1O88456 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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