Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma3O70435 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma3O70435 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma3O70435 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psma3O70435 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma3O70435 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psma3O70435 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms