Protein–RNA interactions for Protein: O70404

Vamp8, Vesicle-associated membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp8O70404 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vamp8O70404 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vamp8O70404 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms