Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HcrtO55241 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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HcrtO55241 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HcrtO55241 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HcrtO55241 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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HcrtO55241 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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HcrtO55241 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HcrtO55241 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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HcrtO55241 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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HcrtO55241 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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HcrtO55241 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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HcrtO55241 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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HcrtO55241 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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HcrtO55241 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HcrtO55241 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HcrtO55241 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms