Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp2a2O55143 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms