Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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BckdkO55028 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BckdkO55028 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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BckdkO55028 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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BckdkO55028 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BckdkO55028 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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