Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf13O54965 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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