Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms