Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limk2O54785 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limk2O54785 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limk2O54785 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limk2O54785 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms