Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gp1baO35930 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms