Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf9O35739 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf9O35739 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Klf9O35739 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf9O35739 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf9O35739 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf9O35739 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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