Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RaxO35602 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RaxO35602 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RaxO35602 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RaxO35602 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RaxO35602 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RaxO35602 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RaxO35602 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RaxO35602 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RaxO35602 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RaxO35602 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RaxO35602 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RaxO35602 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RaxO35602 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RaxO35602 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RaxO35602 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RaxO35602 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RaxO35602 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RaxO35602 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RaxO35602 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RaxO35602 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RaxO35602 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RaxO35602 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RaxO35602 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RaxO35602 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RaxO35602 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RaxO35602 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RaxO35602 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RaxO35602 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RaxO35602 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RaxO35602 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RaxO35602 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RaxO35602 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RaxO35602 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RaxO35602 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RaxO35602 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RaxO35602 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RaxO35602 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RaxO35602 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RaxO35602 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RaxO35602 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RaxO35602 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RaxO35602 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RaxO35602 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RaxO35602 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RaxO35602 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RaxO35602 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RaxO35602 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RaxO35602 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RaxO35602 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RaxO35602 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RaxO35602 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RaxO35602 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RaxO35602 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RaxO35602 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RaxO35602 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RaxO35602 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RaxO35602 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RaxO35602 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RaxO35602 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RaxO35602 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RaxO35602 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RaxO35602 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RaxO35602 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RaxO35602 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RaxO35602 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RaxO35602 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RaxO35602 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RaxO35602 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RaxO35602 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RaxO35602 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RaxO35602 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RaxO35602 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms