Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Opn1mwO35599 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Opn1mwO35599 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Opn1mwO35599 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Opn1mwO35599 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Opn1mwO35599 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Opn1mwO35599 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Opn1mwO35599 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Opn1mwO35599 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Opn1mwO35599 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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