Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6aO35464 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6aO35464 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms