Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pitx3O35160 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pitx3O35160 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms