Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr1aO35134 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr1aO35134 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr1aO35134 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr1aO35134 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr1aO35134 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr1aO35134 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr1aO35134 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr1aO35134 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr1aO35134 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr1aO35134 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr1aO35134 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr1aO35134 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr1aO35134 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr1aO35134 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr1aO35134 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr1aO35134 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr1aO35134 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr1aO35134 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr1aO35134 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr1aO35134 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms