Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Degs1O09005 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Degs1O09005 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Degs1O09005 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms