Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gfra2O08842 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra2O08842 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms