Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms