Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Gm17577J3QNF7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Gm17577J3QNF7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm17577J3QNF7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm17577J3QNF7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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