Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calhm3J3QMI4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calhm3J3QMI4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms