Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm21060J3KMU4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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