Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21897J3KMP5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms