Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pot1bH7BX60 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms