Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm20538F6Z9R1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm20538F6Z9R1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm20538F6Z9R1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms