Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms