Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrdnE9Q9K5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms