Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm5407E9Q7Q1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm5407E9Q7Q1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm5407E9Q7Q1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm5407E9Q7Q1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm5407E9Q7Q1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm5407E9Q7Q1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm5407E9Q7Q1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm5407E9Q7Q1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm5407E9Q7Q1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm5407E9Q7Q1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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