Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms