Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm3250E9Q1M3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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