Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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