Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Myo5cE9Q1F5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Myo5cE9Q1F5 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms