Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms