Protein–RNA interactions for Protein: E9PXM3

Vmn1r177, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r177E9PXM3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r177E9PXM3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r177E9PXM3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms