Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms