Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms