Protein–RNA interactions for Protein: E5D8G1

Galntl6, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Galntl6E5D8G1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Galntl6E5D8G1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Galntl6E5D8G1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Galntl6E5D8G1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Galntl6E5D8G1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Galntl6E5D8G1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Galntl6E5D8G1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Galntl6E5D8G1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Galntl6E5D8G1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms