Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rdh8D3Z6W3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh8D3Z6W3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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