Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430403G16RikD3Z5L4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms