Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms