Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms