Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms