Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cttnbp2B9EJA2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms