Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syce3B5KM66 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce3B5KM66 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms